O Processo Seletivo para o PROBIO ocorre duas vezes ao ano, via edital, e compreende 3 etapas:
1. Análise de projeto de pesquisa (eliminatória, nota mínima para aprovação: 7,00; peso 3,5)
2. Defesa do Projeto de pesquisa (eliminatória, nota mínima para aprovação: 7,00; peso 3,5)
3. Análise do curriculo lattes (Classificatória, sem nota mínima; peso 3,0)
Os editais são lançados normalmente nos meses de março-abril e setembro-outubro de cada ano, sendo disponibilizados para toda a comunidade acadêmica, além de editais institucionais específios para os servidores da ufs e de órgãos conveniados.
A aprovação na seleção e ingresso no curso não estão condicionados ao recebimento imediato de bolsas, uma vez que as mesmas precisam ser disponbilizadas pelos órgãos de fomento a pós-graduação do Brasil (CNPq, CAPE, FAPITEC) ou por repasse de bolsas de discentes que concluiram o curso.
Os projetos de pesquisa deverão versar sobre temática ligada às linhas de pesquisa dos(das) pretensos(as) orientadores(as), conforme descrito nos editais. Recomenda-se também contato com pretensos(as) orientadores(as) para saber mais sobre as linhas de pesquisa.